La disposizione fonica è l'elenco dei registri dell'organo – cioè dei colori prodotti da ciascuna fila di canne. La disposizione fonica e molte altre caratteristiche cambiano a seconda del momento storico e del Paese di costruzione di ogni organo. Combinando i registri, l'organista ottiene diversi colori di suono e realizza sonorità contrastanti, sulle tastiere e sulla pedaliera. Questa varietà di combinazioni è una delle caratteristiche specifiche dell'organo.
L'organo della Chiesa parrocchiale di Gignese presenta due tastiere di 61 tasti e una pedaliera di 32 pedali.
Registri della prima tastiera (Grand'organo)
Principale 16'
Principale 8'
Dulciana 8'
Flauto traverso 8'
Ottava 4'
Quintadecima 2'
Ripieno 1'1/3
Voce Umana
Registri della seconda tastiera (Organo espressivo)
Principalino 8'
Bordone 8'
Viola 8'
Ottava 4'
Flauto 4'
Pienino 2'
Tromba 8'
Concerto viole
Tremolo
Registri della
pedaliera
Basso violone 16'
Subbasso 16'
Ottava 8'
Bordone 8'
Unioni e accoppiamenti, accessori
Tutte le unioni, superottave e subottave usuali
Quattro combinazioni aggiustabili
Quattro combinazioni fisse, pedale automatico
Somiere elettropneumatico e trasmissione elettrica.